常见问题#
我们收集了用户使用 GraphScope 过程中的常见问题,如果在下面的列表中仍然无法找到您遇到的问题的答案,可通过提交 Issues 或者在 Discussions 与我们联系。
运行 GraphScope 系统需要的最小资源是多少?
在通过 Python 客户端使用 GraphScope 过程中,需要的最低 Python 版本是3.6+,最低pip版本是 19.0+,GraphScope 系统支持以单机或分布式的方式部署,单机情况下,资源需求 CPU >= 4 核,内存 >= 8 G; GraphScope 在支持以下环境中运行
CentOS 7+
Ubuntu 18.04+
macOS 12 (Intel/Apple Silicon)
对于分布式部署,需要用户拥有一个 Kubernetes 集群,GraphScope 在 Kubernetes version >= v1.12.0+ 的环境上测试通过。
GraphScope 是否强依赖 Kubernetes?
GraphScope 支持在单机模式安装运行。 GraphScope 的预编译包以 Python wheel 的形式分发,可以用
pip
快速安装:pip3 install graphscope。如何如查看 GraphScope 的运行时信息?
默认情况下,GraphScope 运行不打印日志信息,你可以通过
show_log
参数开启日志输出。graphscope.set_option(show_log=True)
如果您的GraphScope运行在k8s集群上,可以使用 kubectl describe/logs 来查看系统的当前状态,同时如果你可以访问 Pod 的磁盘,也可在 /tmp/gs/runtime/logs 目录下查看运行时日志。
为什么在使用 kubectl get pod 命令时,发现了一些多余的 Pod?
对于其中一些失败的 Pod,只能通过手动执行命令如 kubectl delete pod <pod_name> 进行删除。 通常情况下,该问题出现在使用 Helm 部署 GraphScope 时,GraphScope 依赖一些权限来删除运行时的资源,如果用户没有正确设置
role
和rolebinding
等权限,helm uninstall <release-name> 可能不能正确回收分配的资源。详细细节可以查看 Helm SupportGraphScope 是图数据库吗?
GraphScope 并不是一个图数据库,但其包含一个持久图存储的组件 graphscope-store 可以被用作数据库。
GraphScope 在 Gremlin 上的兼容性如何?
目前,GraphScope支持Gremlin语言中的大部分查询算子,可通过 该文档 查看详细的支持信息。
GraphScope 看起来在运行过程中卡住了?
如果 GraphScope 看起来像卡住,可能的原因有:
在会话的拉起阶段,如果当前网络下载镜像过慢,或当前集群资源无法满足请求的资源时,会造成卡住的现象。
载图阶段,可能会由于数据量过大造成短暂的卡住现象。
在执行图算法分析阶段,或者使用用户自定义的算法,编译构建应用的库时会花费一些时间。
为什么载图时报找不到文件的错误?
这通常发生在以集群方式部署运行 GraphScope 时,数据文件必须要对
engine
Pod 可见。你也许需要挂载磁盘或者使用云存储提供商的服务。如果你的集群是使用 kind 部署的, 你应该需要设置 extra-mounts 来把本机目录挂载到 Kind 虚拟的 Node 中。
k8s_vineyard_mem
,vineyard_shared_mem
和k8s_engine_mem
有什么区别,如何设置?k8s_vineyard_mem
: 为vineyard
容器分配的内存。它存储由vineyard
管理的原始数据的 的元信息,例如形状、ID、名称等。由于元数据比数据集小得多,因此在大多数情况下默认配置就足够了。 它相当于 graphscope 的 helm chart 中的vineyard.resources.memory.requests
和vineyard.resources.memory.limits
。vineyard_shared_mem
: 存储数据集的内存。我们发现将其设置为数据集在磁盘上的大小的 5 倍通常是一个合理的值。 它相当于 graphscope 的 helm chart 中的vineyard.shared_mem
。k8s_engine_mem`: ``engine
容器的内存大小。一般将其设置为vineyard_shared_mem
的同样大小。它相当于 graphscope 的 helm chart 中的engines.resources.memory.requests
和engines.resources.memory.requests
。
导致在 Apple M1 python3.8 环境下安装 GraphScope 失败的原因可能有哪些?
编译
grpcio
失败: 你可以通过export GRPC_PYTHON_BUILD_SYSTEM_OPENSSL=True
来尝试使用系统安装的openssl
编译 grpcio。详情可参考 grpc issue编译
scipy
失败: 你可以根据 此教程 来源码编译,或尝试通过pip3 install --pre -i https://pypi.anaconda.org/scipy-wheels-nightly/simple scipy
来解决这个问题。
在 NFS 上分配 PV 时遇到了
Permission denied
问题,如何解决?Appearance: 通常当使用 helm 的方式安装 graphscope-store 时,Pod
graphscope-store-kafka-0
,graphscope-store-zookeeper-0
会报CrashLoopBackOff
错误Check: 我们通过
kubectl logs graphscope-store-zookeeper-0
来查看日志,此时日志显示mkdir: cannot create directory '/bitnami/zookeeper/data': Permission denied
Solution: 通常有两种解决方式:
快速的方式是在所有相关的 PV 目录上使用
chmod 777
,但不建议在生产环境中使用。优雅的方法是首先创建
graphscope
用户和用户组,然后将graphscope
上的访问权限授予相关NFS目录。
为什么在 Kubernetes 集群上拉起 GraphScope 实例时,产生超时异常?
大多数情况下,超时的原因是因为在 Kubernetes 集群拉起 GraphScope 实例时需要下载对应镜像,这一步通常需要几分钟的时间,你可以通过
graphscope.set_option(timeout_seconds=600)
适当的增加超时等待时间来解决该问题。启动GraphScope时由于连接v6d,etcd等组件失败而导致GraphScope启动失败?
这可能是由于你所使用的机器(或容器)所在的企业网络内要求相应的代理设置方可正常使用网络。这些代理设置可能会导致错误的地址解析以及端口占用。为避免类似情况,可在环境变量
no_proxy
或NO_PROXY
中加入GraphScope相关的地址,如hostname -i
以及0.0.0.0
(请注意`no_proxy的前后缀规则 <https://unix.stackexchange.com/questions/23452/set-a-network-range-in-the-no-proxy-environment-variable>`_)
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